故事讲述了以刀哥（陈小春 饰）和高飞（彭敬慈 饰）为首的一群普通人，在一场离奇的地铁事故中，遭遇到变异嗜血的生化蜈蚣，众人从一开始的猜忌自保，到最后齐心协力共同对战地底巨兽的故事。影片中凶残无比的怪异巨型蜈蚣、诡谲莫测的地下洞窟、坠落深渊的环线地铁，所有的一切都让逃生之路变的危机重重。

　　未来世界，地球因环境污染而千疮百孔，人类家园破败萧条。一颗陨石突然撞击地球，并带来杀伤力极强的外星生物，560万人将因此失去生命。人类命运岌岌可危，总指挥李升（张家辉 饰）派出以军人泰来（古天乐 饰）为首的精英部队前往执行改造计划，部队却突遭暴力攻击，只有泰来和通讯兵光仔（万国鹏 饰）幸存。军官谭冰（刘嘉玲 饰）坚持执行PlanB，指挥官郑重生（刘青云 饰）反对并找来旧友臭鼬（姜皓文 饰）前往支援。拯救家园刻不容缓，但在通讯员小绿（吴倩 饰）悄悄提醒下，泰来发现了一个足以毁天灭地的邪恶阴谋……

　　1997年前夕，香港回归在即。近百年的殖民时代即将落下帷幕，而香港的繁荣与衰败也将迎来翻天覆地的改变。时代变革大潮在即，作为黑帮龙头老大的林耀昌（任达华 饰）敏锐把握到时代的脉搏，他致力坚守盗亦有道的原则，和一众兄弟笃定前行。而在他的麾下，勇猛果敢的阿骆（任贤齐 饰）更被林耀昌寄予厚望。但是阿骆的真实身份却是一名警方卧底，他奉上级程国斌（方中信 饰）之命潜伏多年，时刻准备以白克黑。但是混迹黑道多年，阿骆似乎渐渐发生个改变，内心的黑暗面正迅速扩大。
　　沧桑巨变，人心不古……

　　原O记刑警李俊（刘青云 饰）是一名痴迷于破案而对个人生活全然不顾的人，因疏于对家里的照顾，最终妻子抑郁症自杀，在此之后李俊也变得疯疯癫癫，胡言乱语。魔警案后，更是为了办案枪指同袍而被驱逐出警察队伍。17年后，一伙神秘青年连续犯下骇人听闻的杀人案，这些案件无一例外在复刻许多年前轰动一时的案件，而且受害者均为当年案件的嫌疑人，此外他们还会在一起案件后留下下一起案件的卷宗号。显而易见，这更像有组织的受害者遗属复仇事件。在此期间，已经露宿大桥下的李俊精准预测了每次复仇的时间和地点，这令西九的女警陈仪（蔡卓妍 饰）大为叹服，也引起陈仪的同侪兼老公方礼信（林峯 饰）以及李俊的旧搭档黄欣（李若彤 饰）的猜疑。
　　夜幕降临，大雨滂沱，一场神探大战拉开帷幕……